根據內政部統計，民國97年重新清查祭祀公業土地，未申報的土地面積，高達6611公頃，至今年3月底，仍有5389公頃祭祀公業土地沒有申報，即將被政府標售。明年（102年）元旦起預定開始標售，將優先標售沒人主張、沒人申報的祭祀公業土地，但拍賣時若有人聲明異議，主管機關將暫緩標售。

多達八成以上祭祀公業土地未提出申報，但清理期限已在今年6月底到期，未完成申報的土地，若以面積一公頃的標準足球場換算，相當於5000個足球場的土地面臨標售。立委質疑政府標售人民土地的動機與正當性。

內政部統計，祭祀公業條例修正公告後，民國97年7月以前清查公告的祭祀公業資料顯示，已完成祭祀公業申報土地面積為5058公頃。但是在97年之後的清查公告中，未申報的祭祀公業土地面積，高達6611公頃，自97年7月至101年3月31日為止，6611公頃的祭祀公業土地中，僅有1222公頃在期限內受理申報，受理申報率約18.4%。

內政部表示，法人或自然人等行為能力人，才有能力處理土地，祭祀公業並非法人，也非自然人，是否有能力處理祭祀公業土地，備受爭議。譬如政府徵收土地時，該與哪個權利主體接觸、徵收費用應該給誰等，都是問題。為健全祭祀公業的地籍管理，勢在必行。今年6月底到12月底辦理標售的前置作業。

內政部說，祭祀公業條例已給予三年時限，以釐清權利主體，若無法釐清權利主體，或根本沒人申報、主張權利，表示土地無主，主管機關會將土地公告一段期間後標售拍賣。拍賣時若有人聲明異議，會暫緩拍賣，且拍賣所得金額會留下，民眾若在10年內釐清相關權利，都可向政府領取。